Η Κατηγορία δεικτών πολυκεντρικότητας απαρτίζεται από ένα σύνθετο δείκτη, από 7 βασικούς δείκτες και από 8 συμπληρωματικούς δείκτες. Οι βασικοί δείκτες συνιστούν τις κρίσιμες εισροές για την ποσοτικοποίηση του σύνθετου δείκτη ενώ οι συμπληρωματικοί δείκτες αξιοποιούνται για την ποιοτική - ερμηνευτική προσέγγιση της πολυκεντρικότητας αλλά και για την κατανόηση φαινομένων χωρικής - αναπτυξιακής πόλωσης και ροών. Ο σύνθετος δείκτης χρησιμοποιεί ως εισροές τα αποτελέσματα των βασικών δεικτών για να αποδώσει μια συνολική τιμή που συνιστά το βαθμό πολυκεντρικότητας του εξεταζόμενου χώρου.
Η Κατηγορία δεικτών διατροπικότητας των μεταφορών απαρτίζεται από ένα σύνθετο δείκτη, από 3 βασικούς δείκτες και από 4 συμπληρωματικούς δείκτες. Οι βασικοί δείκτες συνιστούν τις κρίσιμες εισροές για την ποσοτικοποίηση του σύνθετου δείκτη ενώ οι συμπληρωματικοί δείκτες αξιοποιούνται για την ποιοτική κατανόηση των συνθηκών προσφοράς και λειτουργίας της μεταφορικής υποδομής. Ο σύνθετος δείκτης χρησιμοποιεί ως εισροές τα αποτελέσματα των βασικών δεικτών για να αποδώσει μια συνθετική τιμή που συνιστά το βαθμό διατροπικότητας του συστήματος μεταφορών του εξεταζόμενου χώρου, όπως αυτός εκφράζεται από τη δυνητική προσπελασιμότητα πόλεων και τερματικών σταθμών.
Η Κατηγορία δεικτών εδαφικής συνεργασίας απαρτίζεται από ένα σύνθετο δείκτη, από 4 βασικούς δείκτες και από ένα συμπληρωματικό δείκτη. Οι βασικοί δείκτες συνιστούν τις κρίσιμες εισροές για την ποσοτικοποίηση του σύνθετου δείκτη, ενώ ο συμπληρωματικός δείκτης αξιοποιείται για την ποιοτική κατανόηση φαινομένων συνεργασίας βάσει των ευκαιριών χρηματοδότησης από τα διαθέσιμα ευρωπαϊκά προγράμματα. Ο σύνθετος δείκτης χρησιμοποιεί ως εισροές τα αποτελέσματα των βασικών δεικτών για να αποδώσει μια συνθετική τιμή που συνιστά το βαθμό εδαφικής συνεργασίας του εξεταζόμενου χώρου.
Για την περίοδο 2017-2023 το Παρατηρητήριο της Εγνατίας Οδού χρηματοδοτείται από το Επιχειρησιακό Πρόγραμμα «Υποδομές Μεταφορών, Περιβάλλον και Αειφόρος Ανάπτυξη 2014-2020» (ΕΠ-ΥΜΕΠΕΡΑΑ), στο πλαίσιο του ’ξονα Προτεραιότητας "Τεχνική Συνδρομή Ταμείου Συνοχής", σύμφωνα με απόφαση της Ειδικής Γραμματέως Διαχείρισης Τομεακών ΕΠ ΕΤΠΑ και ΤΣ (Απόφαση ΕΥΔ/ΕΠ-ΥΜΕΠΕΡΑΑ/οικ.7592-27.06.2017 με ΑΔΑ: 6Σ7Ο465ΧΙ8-228)
Για την περίοδο 2010-2015, το Παρατηρητήριο της Εγνατίας Οδού χρηματοδοτήθηκε από το Επιχειρησιακό Πρόγραμμα "Ενίσχυση Προσπελασιμότητας 2007-2013" (ΕΠ-ΕΠ), ’ξονας Προτεραιότητας ΙΓ' "Τεχνική Υποστήριξη Εφαρμογής Αξόνων Προτεραιότητας Ταμείου Συνοχής"
Για την περίοδο 2003-2008, το Παρατηρητήριο της Εγνατίας Οδού χρηματοδοτήθηκε από το Μέτρο 2.3 του Επιχειρησιακού Προγράμματος «Οδικοί ’ξονες, Λιμάνια και Αστική Ανάπτυξη», Γ ΚΠΣ.